Buscando soluções e tecnologias sustentáveis para a produção de alimentos, o PEP Agroecologia conta com diversas pesquisas que aliam produtividade e conservação dos recursos naturais. Diante das mudanças climáticas e o grande apelo para o equilíbrio ambiental faz-se urgente investigar formas de produção com base ecológica. A utilização de agentes biológicos, táticas de manejo para a agricultura conservativa e/ou regenerativa, agricultura orgânica e diversificada são os pilares do programa. Juntamente a isso, está sendo consolidada uma rede de parcerias e colaborações interinstitucionais que visam a obtenção de resultados que subsidiem relações cada vez mais cooperativas entre os agentes ecológicos e os seres humanos.